MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Nocardioides sp. JS614 chromosome

Total Repeats: 10685

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008699	CAA	2	6	14	19	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_008699	CGC	2	6	22	27	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_008699	CGG	2	6	44	49	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_008699	CGG	2	6	1678	1683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_008699	CGG	2	6	1689	1694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_008699	CGCT	2	8	1713	1720	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_008699	ACGA	2	8	1787	1794	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_008699	CGGC	2	8	1803	1810	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_008699	CCG	3	9	1811	1819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_008699	CAC	2	6	1827	1832	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_008699	ACCT	2	8	1940	1947	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_008699	CAGA	2	8	1949	1956	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_008699	CATC	2	8	1972	1979	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_008699	CG	3	6	2005	2010	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_008699	CGCT	2	8	3263	3270	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_008699	GGA	2	6	3320	3325	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008699	CCGA	2	8	4239	4246	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_008699	CAC	3	9	6147	6155	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_008699	TAT	2	6	6264	6269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008699	GTC	2	6	6279	6284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_008699	CGA	2	6	6296	6301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_008699	GT	4	8	6334	6341	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008699	GCT	2	6	6357	6362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_008699	GGC	2	6	6366	6371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_008699	AGAA	2	8	8565	8572	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008699	G	6	6	12017	12022	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008699	C	6	6	12028	12033	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
28	NC_008699	G	6	6	12059	12064	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008699	GAA	2	6	12095	12100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008699	TCC	2	6	12109	12114	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_008699	CGG	2	6	12125	12130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_008699	CGA	2	6	12155	12160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_008699	AGCA	2	8	12162	12169	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_008699	CGAC	2	8	12193	12200	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_008699	AGCCC	2	10	12218	12227	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
36	NC_008699	CCAG	2	8	12235	12242	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_008699	GTC	2	6	12260	12265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_008699	ACC	2	6	12269	12274	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_008699	CCA	2	6	12346	12351	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_008699	GTC	2	6	12389	12394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_008699	CGGC	2	8	12436	12443	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_008699	TGCG	2	8	12477	12484	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_008699	GGT	2	6	12486	12491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008699	GCG	2	6	12499	12504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_008699	CCGAA	2	10	12508	12517	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
46	NC_008699	AGC	2	6	12538	12543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_008699	GGT	2	6	15472	15477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008699	GCC	2	6	16672	16677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_008699	TGC	2	6	18593	18598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_008699	TCG	2	6	19272	19277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_008699	CCGTG	2	10	19377	19386	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
52	NC_008699	ACC	2	6	19931	19936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_008699	CGC	2	6	20866	20871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_008699	TCCG	2	8	20914	20921	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_008699	GTCGC	2	10	21025	21034	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
56	NC_008699	GT	3	6	21051	21056	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008699	TCCG	2	8	22039	22046	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_008699	CGG	2	6	22056	22061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_008699	CCG	2	6	22068	22073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_008699	CGC	2	6	22172	22177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_008699	CGG	2	6	22194	22199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_008699	GCT	3	9	22207	22215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_008699	CGG	2	6	22231	22236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_008699	TGG	2	6	22246	22251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008699	GGT	2	6	22256	22261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008699	CCT	2	6	22297	22302	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_008699	TCG	2	6	22303	22308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_008699	GATC	2	8	22844	22851	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_008699	CCT	2	6	32292	32297	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_008699	GGT	2	6	32312	32317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008699	CGG	2	6	32347	32352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_008699	GGGC	2	8	32355	32362	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
73	NC_008699	GC	3	6	32417	32422	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_008699	GCG	2	6	32432	32437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_008699	CGT	2	6	32539	32544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_008699	GGC	2	6	32547	32552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_008699	CG	3	6	32616	32621	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_008699	GT	3	6	32658	32663	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008699	C	6	6	32688	32693	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
80	NC_008699	GCG	2	6	32780	32785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_008699	CCG	2	6	32787	32792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_008699	CTC	3	9	34609	34617	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_008699	GTC	2	6	34620	34625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_008699	GCCC	3	12	34706	34717	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
85	NC_008699	GCC	2	6	36825	36830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_008699	CTG	2	6	39006	39011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_008699	GCGG	2	8	39032	39039	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
88	NC_008699	CCG	2	6	39083	39088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_008699	CGC	2	6	39820	39825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_008699	CTC	2	6	41469	41474	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_008699	GGT	2	6	41486	41491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008699	TCC	2	6	43842	43847	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_008699	AG	3	6	43899	43904	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008699	GCC	2	6	45171	45176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_008699	CGG	2	6	45182	45187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_008699	GCC	3	9	46589	46597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_008699	GAGC	2	8	46610	46617	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
98	NC_008699	AG	3	6	49948	49953	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008699	GCC	2	6	51647	51652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_008699	CCGG	2	8	51665	51672	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101	NC_008699	GTC	2	6	52854	52859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_008699	CT	3	6	54108	54113	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_008699	ACGA	2	8	54130	54137	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_008699	CGT	2	6	54158	54163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_008699	GTG	2	6	54215	54220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008699	CTG	2	6	54230	54235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_008699	GCC	2	6	54267	54272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_008699	GA	3	6	54276	54281	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008699	CGG	2	6	54289	54294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_008699	CGCC	2	8	54350	54357	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
111	NC_008699	GGC	2	6	54376	54381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_008699	CG	4	8	54389	54396	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_008699	ACGG	2	8	54446	54453	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
114	NC_008699	CGA	2	6	55069	55074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_008699	CCG	2	6	55098	55103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_008699	CCG	2	6	55172	55177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_008699	TGC	2	6	55248	55253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_008699	TGC	2	6	55266	55271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_008699	CCG	2	6	55389	55394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_008699	CAGC	2	8	55430	55437	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
121	NC_008699	CGG	2	6	55453	55458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_008699	TCT	3	9	55509	55517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_008699	GC	3	6	55629	55634	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_008699	GC	4	8	55679	55686	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125	NC_008699	CCG	2	6	55705	55710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_008699	CCA	2	6	55711	55716	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_008699	TCA	2	6	55834	55839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_008699	CGC	2	6	55849	55854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_008699	CGC	2	6	55858	55863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_008699	CGC	2	6	55883	55888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_008699	CCGC	2	8	55894	55901	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
132	NC_008699	CGA	2	6	55930	55935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_008699	GTC	2	6	56002	56007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_008699	CGG	2	6	56034	56039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_008699	ACG	2	6	56168	56173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_008699	GC	3	6	56221	56226	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137	NC_008699	TCG	2	6	56252	56257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_008699	CCT	2	6	56302	56307	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_008699	CAAG	2	8	56350	56357	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_008699	ACC	2	6	56440	56445	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_008699	GAG	2	6	56473	56478	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
142	NC_008699	CCG	2	6	56486	56491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
143	NC_008699	TGC	2	6	56556	56561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_008699	AGG	2	6	56583	56588	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
145	NC_008699	CCG	2	6	58070	58075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
146	NC_008699	TGG	2	6	58105	58110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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422	NC_008699	AGG	2	6	135335	135340	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
423	NC_008699	CCGG	2	8	136805	136812	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
424	NC_008699	CAC	2	6	136820	136825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
425	NC_008699	CGC	2	6	136826	136831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
426	NC_008699	TCC	2	6	136839	136844	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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